中国医学科学院阜外医院始建于1956年，是一所集医疗、科研、预防和人才培养于一体的三级甲等专科医院，是北京市医保定点单位。
2021年8月，中国医学科学院阜外医院实验诊断中心被评选为第20届全国青年文明号。
2021年11月20日，入选2020年度中国医院综合排行榜。2021年12月3日，门头沟区政府与中国医学科学院阜外医院签署战略合作框架协议，共同推动首批国家医学中心阜外西山院区落地门头沟。
大步向前的科研成绩
建院68年来，阜外医院共斩获科研成果361项，其中国家科学进步奖（含全国科技大会奖）46项，部委级成果奖187项，获国家专利713项，发表学术论文14192篇,出版专著341部。自1998年至2023年SCI收录论文5403篇，全院发表在影响因子大于5的期刊（The Lancet《柳叶刀》、The New England Journal of Medicine《新英格兰医学杂志》、Circulation《循环》杂志等）论文2075篇。牵头和参与了国家“七五”以来的心血管领域攻关项目126项和“973”、“863”、“十一五”、“十二五”、“十三五”、“十四五”等重大项目，获得科研立项1805项。阜外医院心血管病学、心血管外科学连续十年名列年度学科榜单首位。心血管病学、心血管外科学名列五年总科技量值(ASTEM)榜单首位。
影响深远的国际交流
阜外医院立足“国际”心血管病医院建设，积极推进高水平、多层次国际合作。持续保持与加强同国际医学机构合作，组织参加或开展多项国际多中心临床研究。围绕服务“一带一路”战略，与沿线多个国家心血管医院签署合作协议，开展境内外发展中国家青年医生培养教育活动，推动“一带一路”沿线国家提高心血管病防治水平。积极扩大阜外品牌影响力，积极主办和引进高水平国际学术会议，中国心脏大会、中国血管大会等，吸引和邀请国际学者参会并发布国际研究成果。
打造了全国性心血管疾病资讯平台
中国心脏大会前身为北京国际心血管病论坛，自2004年首次举办至今已连续举办二十届，通过搭建全球性的心血管疾病防治学术交流的舞台，促进国内外业界同行互融互通，营造良好行业氛围。自2005年起，阜外医院已连续18年对外发布《中国心血管健康与疾病报告》，充分发挥咨询平台和专家智库的作用，为我国心血管防治研究提供技术指导与评价，为政府制定相关政策与策略提供决策依据。除此之外，阜外医院制定《高血压防治基层实用指南》《中国高血压防治指南》和《中国成人血脂异常防治指南》《心脏性猝死的标准》等行业规范文件。