长期从事风湿临床免疫基础和临床研究。首次发现：新生抗原介导了强直性脊柱炎发病，是该领域里程碑式重大发现（Science，2023）；类风湿关节炎滑膜中铁死亡机制；CD147是病毒和疟原虫入侵人体新受体。研发成功抗恶性疟疾和重症新冠病毒感染特异创新；建立了炎性关节炎内外科综合诊疗关键技术体系，首先提出“AS合并髋关节炎MRI评估标准”，主持建立《ANCA检测技术》和《中轴型脊柱关节炎综合评估》中国专家共识。
1993年12月，时任传染科副主任医师、副教授的朱平已在传染病领域积累了丰富的临床经验，关于流行性出血热发病机制的研究项目获得军队科技进步二等奖，但她毅然服从医院发展需要的安排，调任至彼时“一穷二白”的免疫科，从头做起。
朱平秉持医无止境、倾心育人的初心，在风湿病、临床免疫学领域的道路上砥砺奋进，主编和翻译了多部教育部研究生、本科生统编教材专著。她主编的全国高等医学院校本科生教材《临床免疫学》和专科医师参考书《实用临床免疫学》，至今仍是该领域经典的专著。
在教学中，她毫无保留地将自己所学传授给学生。临床工作中，她经常提醒学生“进行诊断前，一定要多看资料和病案、多看片子、多观察病人，真正做到心中有数”。如今，她的学生大部分已步入学科带头人的行列，很多学生在风湿免疫学科研和医疗领域取得了突出成绩。