CT的工作程序涉及以下几个关键步骤：首先，根据人体不同组织对X线的吸收和透过率的不同，使用高灵敏度仪器对人体进行测量。测量所获取的数据随后被输入到电子计算机中进行处理，终生成人体被检查部位的断面或立体图像，从而能够发现体内检测部位的细小病变。
扫描部分
扫描部分是CT设备中直接与患者接触并进行成像的部分，它由以下几个关键组件构成：
X线管：这是产生X射线的装置。X线管能够发射出穿透人体组织的X射线束，是CT成像的基础。
探测器：探测器的作用是接收穿透人体后的X射线，并将其转换为电信号。随着技术的发展，探测器的 数量已经从初的单个发展到多达4800个，这大大提高了成像的效率和质量。
扫描架：扫描架是支撑X线管和探测器的机械结构，它允许X线管和探测器围绕患者旋转，以获取不同角度的图像数据。
计算机系统
计算机系统是CT设备的“大脑”，负责处理由扫描部分收集到的数据。计算机系统的主要功能包括：
数据存储：将探测器收集到的电信号转换为数字数据，并存储在计算机系统中。
数据处理：利用复杂的算法对收集到的数据进行分析和计算，以重建出人体的横断面图像。
图像重建：计算机系统能够快速运算，实现图像的即时重建，这对于临床诊断具有重要意义。
活体组织检查 从患者身体的病变部位取出小块组织（根据不同情况可采用钳取、切除或穿刺吸取等方法）或手术切除标本制成病理切片，观察细胞和组织的形态结构变化，以确定病变性质，作出病理诊断，称为活体组织检查（biopsy），简称活检。这是诊断肿瘤常用的而且较为准确的方法。近年来由于各种内窥镜（如纤维胃镜、纤维结肠镜、纤维支气管镜等）和影像诊断技术的不断改进，不但可以直接观察某些内肿瘤的外观形态，还可在其指引下准确地取材，进一步提高了早期诊断的阳性率。