王永钧长期从事肾脏病临床及研究，对中医经典和历代名家学术思想颇有研究。
王永钧带领肾内科团队，创建了IgA肾病从虚、瘀、风湿辨治体系，提出IgA肾病五型辨证新方案 。王永钧将中西医融会贯通，总结出了慢性肾病临床演变规律，发展了肾脏病中医辩证理论，提出“风湿致肾病”学说和“肾脏微症积”的肾微观辩证法，完善肾脏病中医微观辨证体系，应用源自中华文化的“象思维”，结合“审病—辨证—治病/证”的临床思维方法，拓展了“四诊”视野 ，在此指导下形成了一套分阶段辩证的方案和系列组方，并在临床、科研与实践中得以运用。
很多人都不知道就这样一位名满中医界的“国医大师”，却是“半路出家”。那么，为什么他会选择做一个医生呢？每个医生都有自己的原因，但是王永钧之所以选择当一名医生，还源自于自己得了一场大病？
王永钧18岁的时候，得了肾病综合征，到处求医看诊，治了三年多，到过多家医院，很多医生都是束手无策。后来机缘巧合之下，经民间一位中医用，王永钧竟然奇迹般痊愈了。
王永钧感到非常幸运，幸运的是自己打开了中西医这扇门，在中医上遇到的难题，西医能够给他启发。在我多人看来，学中医的人去学西医，就相当于另投门户，在古时候叫“背叛师门”。但是在王永钧看来，“良医是没有门户之见的，他学习西医，并不是改投门户，而是师夷长技，取长补短”。
《肾病门诊》详细介绍了肾病诊疗的一些相关知识，还有临床经验，值得很多学习肾病知识的爱好者及从业者学习和参考。
王永钧还参与审定了《王永钧治肾经验集》一书。这本书中记载了王老多年行医的经验，还总结了肾病的经验 总结，有着非常高的医学价值，对临床肾病具有很好的参考性，对很多中医从业者起到了积极的作用。