北京301医院拥有1个国家重点实验室、2个教育部重点实验室、9个北京市重点实验室，12个全军医学专业重点实验室，国家临床医学研究中心1个，国际联合研究中心1个，形成了以综合诊疗为特色的13项专业优势。
令狐恩强率先定名完善消化内镜隧道技术，模糊了消化内外科的界限，替代了一批传统外科手术；率先提出基于保持人体解剖结构不变条件下，达到祛除疾病目的的超级微创手术新概念，替代长期存在以切除器官为代价的手术模式，为未来手术方法学与器械研发指明了方向。
令狐恩强提出的诊断与治 疗一体的LDRf分型记录法，是全世界首 个覆盖全消化道的静脉曲张分型记录法，在全国使用；提出的肝移植术后ERCP胆管狭窄的A/B/C/D 分型法对胆管狭窄的治 疗具有一定的指导意义；提出的贲门失弛缓内镜下I/II/III分型法、与黏膜粘连度a/b/c/d/e/f分级法填补了国际空白，为消化内镜隧道技术的适应证与禁忌症的制定奠定了基础。
与外科手术比较，消化内镜技术便是一种超级微创医疗技术。随着临床医学与迅速发展的光机电信息科学、材料科学以及生物工程科学等领域高新技术的有机结合，有越来越多的手术在内镜下完成，进而成为消化道疾病的常规方法。