木托盘有可能存在病虫害。因此，从防止病虫害的传播，无论是出口还是进口的木质包装箱托盘，必须经过熏蒸处理，并且有木托盘供应商提供的熏蒸热处理证明，否则没有熏蒸证明无法报关出口。
木托盘经过了抛光，使板面的质量有了很大的改善，但木托盘的周边仍露出了芯材，这不仅影响美观，并且在使用过程中容易吸收空气中的水分，引起覆面材料脱胶、开裂、剥落等缺陷，大大缩短使用寿命，因此封边加工技术是木托盘生产中不可缺少的一个工序。
一些叉车工在实际的叉车移动木托盘时，通过叉车两叉对木托盘进行撞击推动，其结果就是使得木托盘上的货物因此倒塌甚至是损坏，缩短木托盘的使用寿命，叉车的不当操作是造成托盘损坏的主要因素，约占80﹪以上;木托盘本就是木材制成的托盘，长期放置在仓库里存储时,，容易出现虫蚀、受潮等情况，也会大大缩短木托盘的使用寿命……使得原本能用5年的木托盘，其使用寿命缩短到了12个月，甚至是更短。
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