CRCC实行主任负责制，设有综合业务部、机车车辆事业部、基础设施事业部、城轨装备事业部和申诉监理部等5个专业部门以及相应的后勤保障部门。CRCC不以营利为目的，注重社会效益，实行有偿服务。其宗旨是：努力促进产品质量提高，确保运输，服务于绿色轨道交通。其质量方针是客观公正、科学准确、服务规范。

质检部以铁道部产品质量监督检验中心为基础，主要包括质检业务管理室和机车车辆检验站、铁道建筑检验站、通信信号检验站、金属化学检验站、接触网零部件检验站、运输包装检验站、卫生检验站等7个检验站。

CRCC设有综合业务部、机车车辆事业部、基础设施事业部、电务供电事业部、城轨认证事业部（测试评估部）、校准事业部、标准事业部、合作发展部、申诉监理部、办公室、财务部、人力资源部、技管室、科管部和机车车辆、接触网、通信信号、铁道建筑、金属化学、运输包装等检验站等部门和1个分支机构、1个子公司。

申请方提交的申请书和相关材料齐备后，报送CRCC相关技术专家对供货经历进行评价、组织合同评审，并于10个工作日内做出是否受理申请的决定。对受理者，向申请方发出《受理铁路产品认证申请通知书》，对不受理者，书面通知申请企业，并说明理由。