适用于所有公开招标、议标时，业主要求投标人缴纳投标保证金的情况。 招标人为避免投标人在评标过程中改标、撤标，或中标后拒签合同而给自身造成损失，通常都要求投标人缴纳投标保证金，以制约对方行为。投标保函是现金保证金的一种良好的替代形式。
预付款保函在国际承包业务中使用时，是由承包人通过银行向业主提供。保证书规定，如申请人不履行他与受益人订立的合同的义务，不将受益人预付、支付的款项退还或还款给受益人，则由银行向受益人退还该款项。
预付款保函除在国际工程承包项目中使用外，也适用于货物进出口、劳务合作和技术贸易等业务。例如，在成套设备及大型交通工具的合同中，通常采用带有预付性质的分期付款或延期付款支付部分价款。在这种交易中，进口人在签订合同后，向出口人开立履约保证书，由银行保证进口人按合同规定按期支付价款，同时，出口人也向对方开立还款保证书。如出口人不能按期交货，银行保证及时偿还进口人已付款项的本金及所产生的利息。
商业保函简单来说就是商业机构信用担保保证书。
商业保函的官方定义是由除银行以外的，实力雄厚的商业机构出具的保函，一般多为专业担保公司开具的公司保函,是商业机构信用担保。包括程担保公司出具的投标保函，履约保函，预付款保函，质量保函，农民工工资支付保函，都为商业保函。商业保函是以商业机构信用为担保，承担人是商业机构，属于商业信用。
商业保函和银行保函具有同样的法律效益，不过商业保函比银行保函更便宜，办理手续更简便，免收保证金，只收取担保费，所以更多人会选择商业保函。
商业保函与银行保函有什么区别
1、信用不同。银行保函是由银行直接出具的，属于银行信用，而商业保函是由专业的担保机构或商业机构出具的，属于商业信用。
2、用途不同。银行保函多用于国际贸易，国内会比较少，属于国际担保业务，而商业保函多用于国内国家。
3、商业保函相对于银行保函要简单上许多，其不需要准备太多的资料，而且办理速度快，费用也比较低。
4、商业保函的格式条款相对于会灵活一些，而银行保函的格式就会比较严谨，不能随意更改。