保函种类是可分为信用保函和付款保函。信用保函指被保证人不对受益人履行义务，保证人应负责赔偿受益人经济损失的保函。主要有借款保函、投标保函、履约保函、预付款保函、付款保函、维修保函、质量保函等。
支付保函：
是应业主(买方)申请，向施工方(卖方)提供保证担保，在施工方(卖方)按合同正常提供货物、相关服务或完成约定工程量后，如业主(买方)不按约定支付合同款项，则担保方接到施工方(卖方)索赔通知后代为支付相应款项
差额保函：
为防止投标人低价抢标，招标文件会设置一个风险控制价(一般为招标上限价的85%，亦有例外，具体看招标文件规定)，凡低于该风险控制价的，中标人在提交履约保证金的同时必须额外提交中标价与风险控制价之间的差额担保，可以用保证金的方式，亦可用保函的方式，用保函方式提交的，该保函即为差额保函(风险控制价-中标价=差额)。一般差额保函金额超过中标价的20%，风险较大，原则上不予办理。
预付款保函与履约保函的区别：
履约保函是为了保证中标单位如约履行工程合同的内容
预付款保函是保证在甲方支付了预付款之后能收到合同约定的效果，也即在甲方支付了预付款之后如乙方没有履行合同，银行则将预付款保函的相应押金交还给甲方作为损失补偿。
也就是说这是两个不同的保函，都是要交的。因此从某一个角度也能体现施工单位的经济实力。
不过不用担心，作为预付款的保函既然是为了保证预付款的，就不像履约保函那样一定要到工程全部建设结束，合同内容履行完毕之后才退还给你。通常是约定保证预付款用在合同上就可以退还了。只是在工程建设前期冻结在银行，后面就解冻了。