昆山市的POS机申请方法步骤如下：

1. 按照当地银行要求提供相关证件资料，包括营业执照、税务登记证、组织机构代码证、法人身份证件等；

2. 通过银行柜台或网上银行等渠道，向银行提交POS机申请表和资料；

3. 银行会对申请材料进行审核和核实，如有不符要求的地方将通知申请人进行修改和补充；

4. 申请审核通过后，银行将发放POS机，并对使用方法和相关费用进行说明；

5. POS机安装上线后，申请人需要使用银行提供的相关软件进行操作和管理。

申请人应该选择一个具有良好信誉和声誉的银行，并了解其POS及使用情况、用户评价等信息；其次，了解银行的服务费用，避免盲目申请造成不必要的成本支出；后，在使用POS机的过程中，需要注意问题，避免信息泄露和不必要的争议。

在进行POS机费率比较时，商户需要考虑多个因素。首先是费率的具体数值，不同服务商的费率可能会有较大的差异。商户应该根据自己的交易金额和预期交易笔数来计算费率对经营成本的影响，选择一个合理的费率。

商户还应该关注服务商的售后服务质量和稳定性。POS机是商户日常经营的重要工具，如果出现故障或者其他问题，商户需要能够及时得到服务商的支持和解决方案。在选择POS机服务商时，商户应该考虑其售后服务质量和口碑。