认证部亦以铁道部产品质量监督检验中心为基础，主要包括业务部、标准协调部、检查检验部、检验协调部和申诉监理部。

CRCC实行总监责任制，设有综合业务部、机车事业部、基础设施事业部、城市轨道设备事业部、投诉监理部等5个专业部门和相应的后勤保障部门。

为确保认证机构的公平性，铁路产品认证管理委员会于2003年4月成立，2012年改为“铁路产品认证公平管理委员会”；“城市轨道交通设备认证工作委员会”成立于2011年10月。

CRCC基于铁道部标准计量研究所和铁道部产品质量监督检验中心，开展国有资产登记和工商登记。共有300多名工作人员和1000多名专兼职检查人员，分别从事铁道行业的标准计量、产品质量检验和产品认证，并配备了相对独立的专业工作队伍。