就工业洁净厂房整体防爆而言，若是其生产条件允许，则设计成单层厂房，有爆炸危险的区域或者房间，尽可能布置在单层厂房之中的靠外墙部位，可通过设置轻质泄爆外墙或者轻质泄爆屋面以达到爆炸时能够很好泄爆的目的。
在进行工业洁净厂房的平面设计之前，应充分考虑各项工艺流程是否需会产生可燃性气体、可燃性粉尘、纤维，并计算其浓度高低等。从而确定洁净厂房内是否需要设置防爆区并计算防爆区的面积。
为了把排风管道对平面布局的影响降到。常见的做法是，洁净区内排风竖管会设计于夹墙之内，后由技术夹层内横管转接排于室外，这一做法要求在平面布局时充分考虑预留夹墙位置及面积。
在洁净等级较低的洁净区，可适当的扩大门斗，从而使得人流、物流在均从门斗穿行的情况下，使相互影响降到。虽然在洁净厂房设计时“人流、物流不交叉”在各大规范法规中出现频率不低，但绝非人流、物流完全不能交叉。