进料加工贸易的进口，其大体的程序差不多。不同的是要先办手册。（关于手册的办理有空再另辟主题）分为进料加工手册和来料加工手册。报关的时候要用加工贸易的手册，再加上一般贸易几口所需的资料进行报关。
再就是缴关税，因为有手册，所以如果你进口的货物是免税的，只缴保证金，有的是需要缴全额的也就是的保证金，有的只缴100元的保证金。这些保证金等你的手册上面的所有进口料件核出口成品都出完了，那就要核销，核销完了你缴的保证金会一分不少的退回给你。和一般贸易所交的关税的操作程序一样。只不过一个是关税，一个是保证金。
理由有以下几点:
1、香港是自由贸易地区，在香港的码头还享有一定时间的免租期，进出口货物不需要关税(大量烟酒除外)
2、手续简单
3、速度超快：正常情况下，香港交货，在三个工作日左右可以到大陆。
4、费用超低：按公斤计算，全包价格进口，香港接到货到大陆全包价。
5、放心：正规手续报关，放心。
进口清关流程
1.进口换单——去货代或船公司换签D/O。（根据手中提单来确定是到何处换单。H B/L货代提单 M B/L船东提单）
2.海关电子申报——电脑预录、审单、发送、与海关联系/放行。
3.报检（三检）——电子申报放行后，凭报关单四联中的一联去商检局办理报价手续，出通关单或敲三检章。
4.报关——递交纸质资料（2014年11月1日起 [1] ，对企业资质有一定的要求）
5.交税——海关审价按照货物对应编码下税率征税
6.查验（如海关认为有必要）——海关根据货物申报品名的监管条件，与当日查验概率给予查验，如有查验会开出查验通知书
7.放行——海关放行有以下几个步骤：1.一次放行2.开出查验通知书或无查验直接2.次放行3.查验后，做关封后放行。
8.提货——放行后，收货人可提取货物至自有仓库、销售等
接货：进口商或国外公司以电话或传真通知进口部人员货物即将入关，操作人员派车到进口商处提取清关文件。委托人应当向货运代理提供所委托报关事项的真实情况。
报关：报关员在接到清关文件后先行审核，审核无误后交由海关进行清关。
出税：在海关审核无误后，将会自动打出一份进口关税税单和增值税税单，由客户直接交纳税金，或由货运代理代垫税金。进口转关货物，按货物运抵指运地海关之日的汇率和税率征税。