工程保函实际上是用保函代替保证金的一种做法。目前正大力向全国推行。
主要有投标保函、预付款保函、履约保函、支付保函、质量保函。
投标保函：即招投标过程中要求投标人提供银行出具的保函，以担保投标材料真实、中标后不会因不正当理由不订立合同。担保金额一般为招标价的3%。预付款保函：即担保预付款会按照合同要求使用。通常施工企业提供一张预付款保函给业主（开发商、保函受益人），业主即拨付同等金额的预付款给施工企业。担保金额一般为合同价的10%-30%。
履约保函：即担保企业签订施工合同后，能按合同履约。担保金额一般为中标价或者合同价的10%-30%。
农民工工资支付保函：即担保业主或者施工企业不拖欠农民工工资。通常受益人是工程所在地社保局或者劳动局或者建设局。
质量保函：即工程竣工验收之后，担保工程质量不出问题。通常质量保函的期限是两年，担保金额为合同价的3%-10%。
预付款保函
预付款保函试用范围：
预付款保函在国际承包业务中使用时，是由承包人通过银行向业主提供。保证书规定，如申请人不履行他与受益人订立的合同义务，不降受益人预付、支付的退还或还款给受益人，则由银行向受益人退还该款项。
预付款保函的作用：
预付款保函既可以有效保障发包方合法权益，又可对承包方提高资本有机工程形成一种激励机制，促使承包方合理配置资金，立足长远，增强企业活力。防止承包方在收到业主的预付款后将款项挪作他用货币宣布破产等。
对办理保函的建议
1.加强对各类保函的研究与控制。特别是各基层经营单位及施工项目负责人，要像对待工程合同一样认真研究各类保函内容，加强工程履约管理和风险控制，达到防止履约风险的目的，避免因违约业主索赔带来的经济损失。根据规定，保函到期前必须从业主处将原件索回交给出具银行才能解除约定，否则将直接影响企业在银行的信用评级。
2.积极扩展保函出具渠道。在招投标阶段，尽量和业主协商使用专业担保公司出具的保函，尽量减少银行保函的使用量，相应减少履约风险。同时应尽力争取业主给施工方办理工程款支付保函，增加经营回旋余地。
3.尽量用闭口保函，慎用开口保函。闭口保函是指有明确有效截止日期的保函；开口保函的到期日期不确定，例如履约担保的有效期应当截止到本工程竣工验收合格之日，所以开口保函更增加了施工方的履约风险。
问题四：投标保函还需要注意哪些问题？
1、投标保函金额不足
一般的招标文件都会明确规定投标保函的金额，一般为投标报价的2%或以上。而一些大型的土建工程也会规定一个具体的固定的具体数额。因此投标人在向银行申请开具投标保函时，应严格按照投标文件里规定的数额来。根据以往的招投标实践案例来看，哪怕投标包含的金额只差一分，也会被废标。
2、投标保函有效期不足
招标文件对于投标保函的有效期一般都有相应规定：“担保人在此确认本担保书责任在招标通告中规定的投标截止期后或在这段时间延长的截止期后30天内保持有效。延长投标有效期无须通知担保人。”但是很多投标人对这一点没有给予足够的重视，因而在向银行申请开具投标保函时，往往将投标保函有效期跟投标文件有效期混为一谈，造成投标保函有效期少30天的现象。
3、投标保函格式不符合招标文件要求
这里的投标保函格式主要指的是投标保函的担保条件，也就是：
（1）、如果委托人在投标书规定的投标有效期内撤回其投标；
（2）、如果委托人在投标有效期内收到雇主的中标通知后：
（a）不能或拒绝按投标须知的要求（如果要求的话）签署合同协议；
（b）不能或拒绝按投标须知的规定提交履约保证金。
而雇主指明了产生上述情况的条件，则银行在接到雇主的次书面要求就支付上述数额之内的任何金额，并不需要雇主申述和证实他的要求。
对于上述投标保函格式，投标商在向银行申请开列时，不得更改。任何更改都将导致废标。
4、投标保函对银行的要求
是否需要开到银行基本户，是否需要五大行或者指定银行等。